Sau năm 1975, huyện Hoài Nhơn có 12 xã: Bồng Sơn, Hoài Châu, Hoài Đức, Hoài Hảo, Hoài Hương, Hoài Mỹ, Hoài Sơn, Hoài Tân, Hoài Thanh, Hoài Xuân, Tam Quan Bắc, Tam Quan Nam.

Ngày 19 tháng 2 năm 1986, chia xã Bồng Sơn thành thị trấn Bồng Sơn và xã Hoài Tiến.

Ngày 7 tháng 11 năm 1986, chia xã Hoài Thanh thành hai xã lấy tên xã Hoài Thanh và xã Hoài Thắng; chia xã Tam Quan Bắc thành hai xã lấy tên xã Tam Quan Bắc và Tam Quan; chia xã Hoài Hảo thành hai xã lấy tên xã Hoài Hảo và xã Hoài Phú; chia xã Hoài Châu thành hai xã lấy tên xã Hoài Châu và xã Hoài Thuận.

Ngày 3 tháng 6 năm 1993, xã Hoài Thắng đổi tên là xã Hoài Thanh Tây; xã Hoài Thuận đổi tên là xã Hoài Châu Bắc; xã Hoài Tiến đổi tên thành xã Bồng Sơn Tây.

Ngày 11 tháng 7 năm 1994, thành lập xã Hoài Hải trên cơ sở thôn Kim Giao của xã Hoài Hương và thôn Diêu Quang của xã Hoài Mỹ; sáp nhập xã Bồng Sơn Tây vào thị trấn Bồng Sơn.

Ngày 26 tháng 12 năm 1997, chuyển xã Tam Quan thành thị trấn Tam Quan.

Từ đó, huyện Hoài Nhơn có 2 thị trấn và 15 xã như hiện nay.

Ngày 9 tháng 1 năm 2011, Bộ Xây dựng công nhận thị trấn Bồng Sơn là đô thị loại IV[2].

Ngày 24 tháng 10 năm 2019, Bộ Xây dựng công nhận khu vực dự kiến thành lập thị xã Hoài Nhơn (gồm toàn bộ 2 thị trấn và 15 xã của huyện Hoài Nhơn) là đô thị loại IV[3].